叉枝蒿，多年生草本。
主根明显，侧根多；
根状茎稍粗，直径4-10毫米，通常木质，具横卧的地下茎，有少数营养枝。
茎少数，成丛，稀单生，高80-120（-150）厘米，紫红色或淡褐色，具细纵棱，分枝多而细，叉开，斜向上，下部枝长15-30厘米或更长，上部枝长5-15厘米；
茎、枝初时被灰白色短柔毛，后渐脱落。
叶纸质，上面初时被灰白色或淡灰黄色柔毛，后脱落，近无毛，偶有少量稀疏的白色腺点，叶背初时被淡黄色柔毛与灰白色蛛丝状短绒毛，后柔毛脱落，留有灰白色蛛丝状短绒毛；
基生叶与茎下部叶卵形或椭圆状卵形，二回羽状全裂或第二回为羽状深裂，每侧有裂片4枚，具叶长柄，花期叶凋谢；
中部叶卵形或长卵形，长4-5厘米，宽3.5-5厘米，二回羽状分裂，第一回为全裂，每侧裂片4（-5）枚，裂片卵形，长 1.5-2.5厘米，宽0.5-1.5厘米，第二回深裂或几全裂，每侧具小裂片3-4枚，小裂片椭圆状披针形或线状披针形，长1-1.5(-2)厘米，宽1.5-2.5毫米，先端有短尖头，边缘偶有1-2枚浅锯齿，中轴有狭翅，叶柄长1-1.5厘米，基部有细小的假托叶；
上部叶一至二回羽状全裂；
苞片叶羽状全裂。
头状花序长圆形或长卵形，直径1.5-2毫米，无梗，基部有小苞叶，在分枝的小枝上排成穗状花序，并在茎上组成开展、具多级分枝的圆锥花序；
总苞片3-4层，外层短小，向内渐长，外层、中层总苞片卵形或长卵形，背面初时被灰白色绒毛，后脱落近无毛，具绿色中肋，边膜质，内层总苞片长圆形或长卵形，半膜质，背面近无毛；
雌花3-5朵，花冠狭管状，檐部具2裂齿或无裂齿，花柱长，伸出花冠外，先端2叉，叉端钝尖；
两性花4-8朵，花冠管状，花药狭线形，先端附属物尖，长三角形，基部钝，花柱近与花冠等长，先端2叉，叉端截形。
瘦果长圆形或长椭圆形。
花果期8-10月。
