舟形马先蒿，一年生或二年生草本，干时略变黑色。
根长2.5-7厘米，老时多少木质化，在顶端有丛生须状支根，下部则有较粗的分枝。
茎纤细而不柔弱，长达15厘米，老时多少木质化，从根茎顶端发出多条，基部多分枝，均铺散地面而倾卧上升，上部亦有分枝，枝均对生，茎枝均无毛或有毛线两条。
叶基出者早枯，茎生者成对，叶柄长4-6毫米，最长者达20毫米，扁平，两侧有狭翅，基部略膨大，生于茎上部者有疏长毛，下部者变为光秃，叶片肾脏形至心脏状卵形，有时几圆形，大者长达12毫米，宽10毫米，一般较小，上面密被短而细的腺毛，背面在碎冰纹的网脉之间有绣色凸起，并另有白色肤屑状物，缘为羽状至掌状半裂至深裂，裂片卵状长圆形，约6-10枚，缘有圆齿。
花成对散生于茎枝端之叶腋中，疏散；
苞片叶状；
花梗纤细，长5-10毫米，最长者可达20毫米，略有毛；
萼管状，长9-12毫米，密被短柔毛，前方稍开裂，主脉5条，仅略粗于遍布上半部的网脉，萼齿5枚，不等，后方1枚较小，狭三角形锐尖头，全缘膜质，后侧方1对最大，基部宽三角形全缘，上半部作宽卵形膨大而绿色，掌状开裂，前侧方1对较小很多，下半部很狭细，上部膨大3裂；
花冠黄白色到玫瑰色，无斑点，长20-25毫米，管伸直，长达12毫米，管喉密被短柔毛，盔下部与管同一指向，上半部则向前作镰状弓曲，盔之极端虽钝头，然外形多少尖削而作舟形，额不高凸或稍稍圆凸，前缘无凹缺，在距顶端3毫米处生有主齿1对，在主齿以上更有附加的小齿两三对，极不明显，下唇较盔为短，无缘毛，略有啮痕状细齿，基部具有短而宽的柄，长仅1-1.5毫米，宽达7.5毫米，裂片约略相等而同形，均为菱状宽卵形，基部略作心脏形，中裂有柄长1.5毫米，与侧裂组成深弯缺而伸出于其前大半，其柄的后方有褶襞两条通向喉部；
雄蕊着生于花管中部以下，花丝上部均无毛，基部及着生点均有毛；
子房后方生有代表花盘的披针形附属物1枚，长约1毫米，下部紧贴于子房，柱头伸出于盔外。
蒴果斜披针状长圆形，长12-13毫米，约伸出于宿萼1/3，下缝线几伸直，上缝线向下弓曲，端有小凸尖。
花期8月，果期9月。
