阿尔泰马先蒿，多年生草本。
根短缩，有粗壮时而分枝的纤维根。
茎多单条，细而常弯曲，疏被长卷毛，常有色泽，高20-40厘米。
叶基出者少数，具短于叶片2倍而光滑的柄，叶片线状披针形，轴有狭翅，羽状全裂，裂片长圆状披针形或披针形，端有胼胝质短尖，其小裂片钝头而具胼胝质粗尖，茎生叶上部者变小，柄较短或无，叶片后部羽状深裂，前部裂片篦齿状，常在基部有加大的裂片。
花序长，花有短梗，下部者疏生；
苞片3裂，侧裂短，其在花序中部者几成齿状，中裂长，处于花序下部者有时较萼长，中部者较短；
萼狭钟形，长10-12毫米，近于革质，主脉明显，有短而斜出的支脉，无毛，带有紫色斑点，或有时有灰色细毛，齿5枚，三角形而短，短于萼管数倍；
花冠黄色，长25-27毫米，在喉部以下膝屈，盔部与管等长，上部镰状弓曲，端有短喙而下缘有2齿，下唇3裂，与盔等长，具长柄，沿缘多少有缘毛；
雄蕊花丝1对有毛。
蒴果几不偏斜，长圆形，具短喙，长1 0毫米。
花期6-7月；
果期7-8月。