高额马先蒿，多年生草本，高达20厘米，干时多少变黑，草质。
根短粗，下方有多数侧根，或单条，多少肉质。
茎常多条，主茎粗可达2.5毫米，侧茎常弯曲上升，有深而狭之沟，沟中密生成行之毛。
叶基生者开花时尚宿存，有膜质长柄长达25毫米，缘有疏而长的白毛，毛长达1.5厘米，叶片约与柄等长，羽状深裂，裂片卵状长圆形，约5对，有缺刻状齿及小裂片，两面无毛，下面有明显的密网纹，茎生叶柄较短，不达1厘米，4枚轮生，每茎一般仅一轮，叶片较短，多少卵形，裂片约4对，长达5毫米，其柄与茎节均密生带紫褐色的长毛，面无毛，背面有白色肤屑状物。
花序头状或下方一轮疏距约1厘米而其余头状，长2.5-3.5厘米；
苞片叶状而短，羽状深裂，裂片仅2-3对，下部者长达6毫米；
萼长4毫米，膜质，管长约3毫米，脉5主5次，均清晰凸起，前方不裂，萼齿长约不及0.5毫米，端常反卷，宽约0.8毫米，色暗绿，有不清晰的锯齿，大小多少不等；
花冠喉部白色，其余浅玫瑰色，长13毫米强，花管细长，基部宽仅1.5毫米，至背线高5毫米而腹线3.5毫米处向前几以直角转折，但在转折之后不远即渐渐弯曲向前上方，此段至喉部长6毫米，其直径几不扩大，至喉部亦仅宽2毫米，下唇长5毫米，宽6.5毫米，侧裂斜卵形，基部与端均圆形，中裂向前凸出一半，宽卵形，宽2毫米，基部狭缩成明显之柄，盔长4毫米，基部宽1.5毫米，中部狭缩，仅宽1毫米，向端又稍稍变宽达1.4毫米，额卵形微尖而顶狭而圆，背经与腹线之轮廓几相等，其前缘开口处离额顶甚远，远1.3毫米，约占全盔自喉部至额顶全长的1/3，在开口处以上稍稍凸出但不显著；
花丝无毛；
柱头不伸出。
花期5-6月。
