掌叶紫堇，无毛草本，高20-40厘米。
须根少数，肉质增粗，短椭圆形至近球形，干时黄褐色，无柄。
茎不分枝，上部具叶，下部裸露，基部线形。
基生叶1-2枚，叶片3全裂，全裂片近圆形或楔状倒卵形，具缺刻，中裂片具柄，侧裂片近无柄，表面绿色，背面具白粉；
茎生叶1-2枚，互生于茎上部，具极短柄或无柄，叶片3全裂，全裂片2-4深裂，小裂片狭倒卵形或椭圆形，先端圆或钝，具小尖头，中脉在背面较明显，其他同基生叶。
总状花序顶生，长3-7厘米，果时达9厘米，有8-12花；
苞片最下部者同上部茎生叶，下部者3裂，其他倒披针形至狭倒披针形；
花梗直立，短于苞片。
萼片鳞片状，早落；
花瓣蓝紫色，上花瓣长1.4-2厘米，花瓣片舟状卵形，鸡冠状突起极狭，距圆筒形，稍长于花瓣片，略下弯，下花瓣舟状倒披针形，长0.8-1厘米，基部具1下垂下距，内花瓣长7-8毫米，花瓣片倒卵状长圆形，具1侧生囊，爪狭楔形，稍短于花瓣片；
雄蕊束长约6毫米，花药极小，花丝狭披针形，蜜腺体贯穿距的2/5；
子房椭圆形，长约3毫米，具多数胚珠，花柱与子房近等长，柱头双卵形，上端具4乳突，基部两侧各具1乳突。
蒴果狭倒卵形，长1.2-1.5厘米，具数枚种子，排成2列，自果梗先端反折。
种子近圆形，黑色，具光泽。
花果期6-9月。