小距紫堇,无毛草本,常多数丛生,高15-30厘米。
须根多数成簇,纺锤形至长圆状肉质增粗,长0.5-3厘米,粗3-5毫米,两端渐狭或突然变细,褐色,具长短不等的柄。
茎1-7条,不分枝或稀上部具1-2分枝,上部具叶,下部裸露,基部变细。
基生叶2-5枚,叶柄纤细,长4-11厘米,叶片轮廓圆形,二回三出羽状分裂,小裂片倒卵形,长5-10毫米,先端钝,具尖头,基部宽楔形,略下延,叶脉纵向;
茎生叶1-3枚,互生,具短柄或无柄,叶片轮廓三角形至圆形,下部叶长和宽达3厘米,二回三出羽状分裂,小裂片披针形至线形,长0.5-1.5厘米,先端急尖,其他同基生叶。
总状花序顶生,长4-10厘米,多花,排列疏松;
苞片下部者与茎生叶同形,向上裂片渐减,至最上部者披针形具齿;
花梗直立,上部者长约2毫米,下部者长达12毫米,果时延长达2厘米,略下垂。
萼片鳞片状,长约0.2毫米,有时具齿,极早落;
花瓣天蓝色,上花瓣长1.5-2厘米,花瓣片卵形,背部具鸡冠状突起,距圆筒形,与花瓣片近等长或稀较长,下花瓣长8-9毫米,半下垂,基部具1下垂小距,内花瓣长约7毫米,花瓣片长圆形,基部两侧具钩状耳,爪楔形;
雄蕊束长约7毫米,花药长圆形,花丝狭卵形,上部渐狭;
子房长圆形,长约4毫米,具2列胚珠,花柱细,长约3毫米,先端弯曲,柱头双卵形,上端具4乳突,基部两侧各具1乳突。
蒴果线状长圆形,长7-10毫米,粗2-3毫米,果梗自基部下弯。
种子数枚,近圆形,直径约1毫米,黑色,具光泽。
花果期6-9月。