凹叶紫菀，多年生草本，根状茎常垂直，粗壮，有长达2-4厘米的细匍枝。
茎直立，高2-8厘米，基部被枯叶残片，不分枝，通常紫褐色，被较密的紫红色毛，通常单生，下部有密集的叶。
基部叶在花期生存，莲座状排列，匙形或长圆状匙形，长1-3厘米，宽0.3-0.5厘米，下部渐狭成具宽翅或狭翅的短柄，顶端圆形，有凹头，近全缘；
茎部叶3-4个，倒披针形，长1-2厘米，宽0.2-0.4厘米，顶端钝；
全部叶质稍厚，两面无毛，常有缘毛，有远基三出脉和近边缘的一对细边脉。
头状花序单生于茎端，径2-2.5厘米。
总苞半球形，径约1厘米；
总苞片2-3层，近等长，长6.5-9毫米，宽1.5-2.5毫米，外层披针形，内层线形，顶端尖或渐尖，上部草质，顶端及边缘带紫色，背面无毛，上部有紫色缘毛。
舌状花约25个，管部长约3毫米，舌片蓝色，长10-18毫米，宽1.5毫米。
管状花花冠长5.5-6毫米，管部长2-2.5毫米，上部紫红色，有浅齿。
冠毛2层，外层短毛状，内层长约5毫米，稍黄褐色，有近等长的微糙毛。
子房长圆形，长1.5毫米，被短粗毛。
花期7-8月。