小尖堇菜，多年生草本，近无地上茎，或地上茎缩短，长仅1厘米。
根状茎细长，具稀疏的节间；
匍匐茎纤细，无毛，长可达15厘米，节处生有多数不定根，顶端发出新植株。
叶近基生或密集于短缩的茎上；
叶片卵状心形或椭圆状心形，长2-5厘米，宽1.5-3厘米，先端尖，基部狭心形，边缘具半圆形粗锯齿，每侧有6-10个齿，齿端具明显的刺尖，刺尖开展或向前伸且顶端常具淡红色腺体，两面均无毛，上面深绿色，下面灰绿色并沿凸起的中脉上常散生刺尖；
叶柄与叶片近等长，长达7厘米，无毛；
托叶仅基部与叶柄合生，分离部分披针形，有褐色条纹，边缘具长流苏状齿。
花白色或淡紫色；
花梗与叶近等长或稍短，中部以上有2枚线形小苞片；
萼片披针形，长约5毫米，宽1-1.2毫米，无毛，有狭膜质边缘，基部附属物短，长不超过1毫米，末端截形，疏生浅齿；
花瓣倒卵形，上方花瓣及侧方花瓣近等长，长约1.3厘米，宽约5毫米，侧方花瓣里面无须毛，下方花瓣较短，连距长约1.1厘米，宽约3毫米；
距粗短呈囊状，长2-2.5毫米，粗2-2.5毫米；
下方雄蕊的距尖角状，长约2毫米，与花药近等长；
子房长圆状球形，无毛，花柱棍棒状，基部稍膝曲，向上渐增粗，柱头顶端稍隆起，两侧增厚成狭的缘边，先端具不明显的短喙，喙端具向上开口的细的柱头孔。
蒴果椭圆形，长约6毫米。
花期4-5月，果期5-6月。
