大理水苏，多年生草本，高60-100厘米；
根茎不增大，匍匐，节上生出纤维状须根。
茎直立，柔弱，不分枝，四稜形，具四槽，上部在稜上有基部具瘤的倒向糙伏毛，余部密被疏柔毛状糙伏毛，下部除稜及节外近于无毛，节间伸长，比叶长很多。
茎生叶披针状卵圆形，长4-8厘米，宽2-2.5厘米，先端锐尖，基部截平或微心形，边缘有圆齿状锯齿，上面绿色，密被绢质糙伏毛，下面较淡，疏被糙伏毛，侧脉3对，上面稍明显，下面显著，叶柄扁平，长1-2厘米，被基部具瘤倒向糙伏毛及疏柔毛状糙伏毛；
苞叶与茎叶近同形，向上渐变小，基部宽楔形至圆形，近无柄，最下部一对苞叶最大，比轮伞花序长得多，上部苞叶稍长于或短于轮伞花序。
轮伞花序通常6花，组成长5-7厘米的穗状花序，下部2-3个轮伞花序稍远离，上部者聚集；
苞片少数，线形，短小，长不及1毫米，被缘毛，早落；
花梗短，长约1毫米，被微柔毛。
花萼钟形，长6-7毫米，外被绢状糙伏毛，内面无毛，5脉，齿5，三角形，近等大或后3齿稍大，长1-2毫米，先端具胼胝尖，边缘有具腺微柔毛。
花冠白色，长约1.3厘米，冠筒长约8毫米，近圆柱形，外面在上面疏被微柔毛，前面在毛环上方略呈浅囊状膨大，内面近基部1/3有斜向间断的微柔毛毛环，冠檐二唇形，上唇直伸，长圆状卵圆形，长5毫米，宽3毫米，外面被微柔毛，内面无毛，下唇水平展开，轮廓卵圆形，宽约5毫米，外面疏被微柔毛，内面无毛，3裂，中裂片近圆形，宽约3毫米，先端微缺，侧裂片卵圆形，宽约1.5毫米。
雄蕊4，前对较长，均延伸至上唇片之下，花丝丝状，中部以下被微柔毛，先端略增大，花药卵圆形，2室，室纵裂，略叉开。
花柱丝状，稍超出雄蕊，先端近相等2浅裂。
花盘杯状，具圆齿。
子房黑褐色，无毛。
花期6月。