黄花地纽菜，多年生草本，高40-70厘米；
根茎不增大，匍匐，在节上生纤维状须根。
茎直立，纤弱，不分枝或在中部以上少分枝，四稜形，具四槽，在棱及节上有倒向具节糙伏毛，节间常伸长，比叶长很多。
茎生叶长圆状卵圆形，长4-10厘米，宽1.8-4厘米，先端锐尖，基部浅心形，有时平截或宽楔形，边缘为规则的圆齿状锯齿，上面绿色，在边缘密生余部疏生糙伏毛，下面较淡，沿肋及侧脉上疏生糙伏毛，余部近无毛，侧脉3-4对，上面不明显或多少凹陷，下面显著且带白色，叶柄长1-5厘米，近于扁平，被糙伏毛；
苞叶向上渐变小，最下方一对苞叶与茎叶同形，基部截平，具短柄，柄长不及1厘米，上部苞叶披针形，无柄，稍长于或短于轮伞花序。
轮伞花序通常6花，组成长5-12厘米的穗状花序，下部的2-3个轮伞花序远离，上部的密集；
苞片少数，线状披针形，短小，长不及1毫米，无毛，早落；
花梗短小，长约1毫米，被微柔毛。
花萼狭钟形，长8毫米，外面沿脉上被具节刚毛，内面无毛，10脉，明显，次脉在萼筒中部以下多少明显，齿5，近等大或后3齿稍大，长三角形，长2.5-3毫米，先端具刺尖，尖头长0.5毫米，边缘有具腺微柔毛。
花冠黄色，长1.5厘米，冠筒长9毫米，向上渐扩大，外面前方在毛环上呈浅囊状膨大，内面近基部有斜向微柔毛毛环，冠檐二唇形，上唇直伸，外面疏被微柔毛，内面无毛，长圆状卵圆形，长5毫米，宽3毫米，先端具波状齿，下唇水平开张，外面极疏被微柔毛，内面无毛，轮廓近圆形，长7毫米，宽6毫米，3裂，中裂片最大，近圆形，宽5毫米，侧裂片卵圆形，宽约2毫米。
雄蕊4，前对较长，均上升至上唇片之下，花丝丝状，扁平，先端微增大，中部被微柔毛，花药卵圆形，2室，室纵裂，略叉开。
花柱丝状，略超出雄蕊，先端近相等2浅裂。
花盘杯状，具圆齿。
子房深褐色，无毛。
花期6-7月。
