松穗卷柏,土生,短匍匐,向上生出几个直立能育枝,高1-4 (-6)厘米,无游走茎。
根托只生于茎的下部,长0.7-2厘米,纤细,直径0.1毫米,根多分叉,光滑。
主茎自近基部开始分枝,通常重复1-2次等二叉分枝,禾秆色,主茎下部直径0.3-0.4毫米,具沟槽,无毛,维管束1条,分枝稀疏,叶状分枝和主茎无毛,背腹压扁,末回分枝连叶宽3.2-4.2毫米。
叶全部交互排列,二形,草质或膜质,表面光滑,边缘不为全缘,不具白边(或边缘微透明),二形。
分枝上的腋叶对称,椭圆形,1.0-1.8毫米×0.3-0.7毫米,边缘具微齿。
中叶多少对称,分枝上的卵圆形,1.2-1.8毫米×0.6-0.8毫米,相互排列不是非常近,背部不呈龙骨状,先端外展或与轴平行,先端渐尖,基部近心形或钝,边缘具睫毛。
侧叶不对称,侧枝上的侧叶卵状三角形,外展,1.8-2.3毫米×0.8-1.2毫米,先端急尖;
下侧基部扩大,略覆盖小枝,上侧边缘具短缘毛,基部具睫毛。
孢子叶穗疏松,背腹压扁,单生于小枝末端或分叉,10-20毫米×3.0-5.0毫米;
孢子叶二形,正置,和营养叶形状,排列一致;
孢子囊只生下侧孢子叶基部,叶不具白边,上侧的孢子叶卵状披针形,边缘具短睫毛,先端渐尖,无孢子叶翼,下侧的孢子叶卵圆形,边缘具短睫毛;
大孢子叶分布于孢子叶穗下部的下侧。
大孢子橘红色或橘黄色;
小孢子橘红色。