深绿卷柏，土生，直立，偶匍匐，或近直立，基部横卧，高30-60厘米，无匍匐根状茎，或游走茎。
根托在主茎与分枝上断续着生，自主茎分叉处下方生出，通常由茎上分枝的腋处下面生出，偶有同时生2个根托，1个由上面生出，长2-12厘米，直径0.2-1.3毫米，根少分叉，被毛。
主茎自近基部羽状分枝，不呈“之”字形，无关节，禾秆色，主茎下部直径0.6-2.4毫米，茎卵圆形或近方形，不具沟槽，光滑，维管束1条; 侧枝6-12对，3回羽状分枝，小枝较密排列规则，主茎上相邻分枝相距2-5厘米，分枝无毛，背腹压扁，主茎在分枝部分中部连叶宽4.5-7毫米，末回分枝连叶宽2.5-4毫米。
叶全部交互排列，二形，草质，上表面具刺突，无虹彩，边缘不为全缘，不具白边。
主茎上的腋叶较分枝上的大，宽卵形或近圆形，基部钝或近心形，分枝上的腋叶对称，卵形，1.2-2.5毫米×0.5-1.5毫米，边缘有细齿。
中叶不对称或多少对称，主茎上的略大于分枝上的，边缘有细齿，先端具芒，基部钝，分枝上的中叶卵形或倒卵形或卵状椭圆形，0.8-1.4毫米× 0.3-0.8毫米，排列紧密，背部略呈龙骨状，先端与轴平行或交叉，具长芒，基部楔形，边缘具细齿。
侧叶不对称，主茎上的较侧枝上的大，分枝上的侧叶卵状三角形或卵状披针形，略斜升，排列紧密或相互覆盖，1.7-4.0毫米×0.5-1.5毫米，先端近尖或钝，上侧基部扩大，加宽，覆盖小枝，上侧基部边缘不为全缘，边缘有细齿，下侧边基部圆形或下延，下侧边近全缘，基部全缘或具细齿，微内卷。
孢子叶穗紧密，四棱柱形，单生于小枝末端，4.0-26毫米×2.0-3.0毫米；
孢子叶一形，卵状三角形，边缘有细齿，白边不明显，先端渐尖，边缘有细齿，龙骨状；
大孢子叶分布于孢子叶穗下部的下侧。
大孢子白色；
小孢子淡黄色。
