丹东玄参的茎四棱形，有浅槽，具白色髓心，不分枝或上部分枝，上面疏生白柔毛。
绿色、紫褐色
丹东玄参的花序顶生和腋生，集成一大型圆锥花序，长达30厘米，总梗和花梗长达1.5厘米，均生腺毛。
丹东玄参的花冠外面绿色而内带紫褐色，长7-8毫米，花冠筒球状筒形。