丛枝囊瓣芹，一年生草本，高20-60厘米，根木质化。
茎纤细，分枝密，基部近丛生状。
叶二型，茎基部的叶片1-2回三出分裂，叶柄长1.5-7厘米，基部有长卵形的叶鞘；
裂片短卵形，顶端3齿，或呈短披针状线形；
茎生叶有短柄，裂片披针状线形，长3-7厘米，宽3-5毫米。
复伞形花序多数，无总苞；
伞辐5-20，不等长，长2-4厘米，被稀疏柔毛；
小总苞片2-3，线状披针形；
小伞形花序有花2-3；
萼齿细小，钻形，与花柱基近等长；
花柱短。
果实卵形，每棱槽内油管1-3，合生面油管2-4。
