东亚囊瓣芹，多年生草本，高10-30厘米，一般高约25厘米，植株细柔。
根茎纺锤形，或细长匍匐，其上有瘤状小节，棕褐色。
茎通常单生，少数有2个，光滑，不分枝或仅有1个分枝。
基生叶有柄，长2-10厘米，基部有阔卵形膜质叶鞘，叶片卵状三角形，近三出式2回羽状分裂，末回裂片倒披针形，长2-3毫米，宽1-1.5毫米；
茎生叶1-2，无柄或有短柄，1-2回三出分裂，裂片线形伸长，长1-2.5厘米，宽约2毫米，极少为三出式羽状分裂。
复伞形花序无总苞；
伞辐5-25，长1.5-3厘米；
小总苞片1-3，披针形；
小伞形花序有花1-3；
萼齿细小；
花柱基扁圆锥形，花柱较短，果实长卵形，长2.5毫米，宽约1毫米；
果棱不明显；
每棱槽内有油管1-2。
花果期4-8月。
