南川马先蒿，多年生草本，干时不变黑色，高15-25厘米。
根多少肉质变粗，径可达3毫米，有分枝；
根茎粗壮，被有卵形的厚鳞片多枚。
茎基部有线状长圆形膜质的鳞叶数枚，多分枝，枝互生，半直立或基部多少倾卧而上部弯曲上升，密生白色长毛，而主茎即不很发达，直立，长仅4-7厘米。
叶互生，在分枝上者互生至亚对生，厚膜质至薄纸质，有柄，柄在主茎上者长可达5厘米，在分枝上者仅长1.5-2厘米，疏被长柔毛；
叶片长圆状披针形至卵状长圆形，长6-11厘米，宽2.5-5厘米，分枝上者较小，长2.5-4厘米，宽1-2厘米，两面均疏被短毛，基部不等，以羽片渐狭的基部成为亚心脏形，端多钝圆或微锐，羽状全裂，裂片每边7-12枚，互生至亚对生，形状与大小变异极大，自菱状卵形而基部长渐狭至线状披针形，基部多下延于轴而为翅，端钝圆至锐头，自身亦为羽状浅裂至半裂，或较小者仅有缺刻状重锯齿，小裂片每边3-6枚，为三角状卵形至长圆状卵形，后缘常长于前缘，大者长达5毫米，有锐锯齿，齿与上卷的叶缘均有白色胼胝。
花腋生而疏，红色，梗长可达3.5厘米，纤细，上部者及分枝上者较短，均被长柔毛；
萼圆筒形，长约10毫米，前方不开裂，沿5条主脉密生长柔毛，此外尚有次脉5-7条，无网脉，齿5枚，近于相等，长约为筒部的1/2强，基部三角形，向上狭缩，至一半以上处又稍稍膨大而有细锯齿，多少披针形至卵形，有毛；
花冠长约3厘米，管长约2.5厘米，细直，被有短柔毛，盔无毛，直立部分短，自基部至盔顶长约6毫米，约以直角折向前方而成含有雄蕊的部分，长约4.5毫米，前方延伸为伸直的喙，长仅3-4毫米，下唇长于盔，长约12毫米，宽约15毫米，以锐角开展，侧裂较大，斜椭圆形，中裂较小，宽过于长，为菱状广卵形，长4毫米，宽5毫米，钝头，二侧不迭置于侧片之下；
雄蕊着生于花管中部，前方1对花丝上部被有微毛；
子房卵圆形，长2-3毫米，柱头不伸出。
