微唇马先蒿，一年生草本，高可达25-30厘米，然有时仅高6厘米即开花，干时绿色，完全光滑无毛。
根圆锥状，下部有细侧根，长达3-5厘米，根颈有卵形至披针形鳞片若干枚，发出1-8条直立或稍稍倾斜上升的茎。
茎有纵条纹，节多者达8枚，疏距，中间之节间长达9厘米。
叶下部者有时对生，中部以上者轮生，下部者具细长之柄达20毫米，上部者柄较短；
叶片卵形至椭圆状卵形，长1.5厘米，宽1厘米，上面干时黑绿色，下面绿色而有清晰之网纹，羽状深裂，裂片倒卵形、长圆形或多少方形，每边3-4对，缘有缺刻状重齿，齿有刺尖。
花序之花轮均疏远，偶有近顶处稍稍稠密者，有时从基部以上第一轮叶中即着花，故常占茎的大部长度；
上方之苞片有细长之柄，仅有三枚小裂而甚短于柄；
花小，长仅9-10毫米，具长1毫米的短梗；
萼小，长仅3毫米，卵状钟形，前方开裂达2/5处，脉8-10条，粗而黑，其余部分薄膜质而无脉，齿5枚，后方一枚最小，长仅0.7毫米，其余4枚较大，长约1毫米，均基部三角形，中下部狭缩而上部扩大，暗绿色，几无齿；
花冠长约5毫米，约在2毫米处以45°角向前膝屈，全长几等粗，仅在近喉处下方有囊状膨大，下唇细小，显短于盔，长仅2.5-3毫米，中裂倒卵形，基部狭缩，向前伸出，端有微凹，侧裂倒卵形，端几方而截形，中间有明显之凹缺，后缘直而不圆，因而组成整个下唇的楔形基部，宽仅略多于1毫米，盔狭而长，达4毫米，上下几等宽，顶平截而额不圆凸；
雄蕊花丝两对均无毛。
蒴果短，长仅8-9毫米，三角状卵形，扁平，有清晰的网纹，下部为宿萼所斜包，前端有刺尖，具长2毫米的柄，柄端弯曲而使蒴果水平生长或多少横展；
种子褐色，长圆形，长3毫米。
花期7月。
