糠秕马先蒿，多年生草本，低矮或多少升高，高6-45厘米，干时不变黑。
根茎极短或稍稍伸长而爬行；
根颈有少数鳞片，鳞片披针形，膜质；
根细须状丛生，内杂纺缍形膨大的块茎。
茎自基部分枝，枝长而疏，斜升，生有疏叶，被毛而具纵沟。
叶互生，具有细长之柄，柄有毛，长15-40毫米；
叶片长25-6o毫米，宽15-40毫米，长圆状卵形至卵形，上面有疏毛或几无毛，有时被有白色糠粃状物，下面网较清晰，被疏毛，更有密生白色糠粃状物，羽状深裂，裂片4-6对，卵形至披针形，裂得最深者可达中肋2/3处，缘有不规则之锯齿。
花序疏总状；
苞片叶状而长于花；
花具短梗，长约1-3毫米，有时更长，几无毛；
萼斜卵状而狭，薄而膜质，长6-7毫米，前方深裂至2/3，密被白色柔毛，外面脉纹显明，齿5枚，长约0.3-1.5毫米，几全缘或有不显之锯齿；
花冠紫红色，管长6毫米，无毛，喉部扩大，脉纹显著扭转，使其冠之上部多少返顾，盔的直立部分约与管等长，端以直角转折而成合有雄蕊的部分，前方再渐狭为喙，喙长约5毫米，端二裂，其裂片自身再作浅二裂，外方一枚小裂卵形，较大很多，较突然地凸出，下唇长于盔，近圆形，中裂长圆形，长5毫米，宽6毫米，顶端平钝，中央微凹，伸出于侧裂之前，两侧被压迭；
雄蕊花丝前方一对疏被长毛，后方一对几无毛；
花柱自喙端伸出。
蒴果披针形，长10-15毫米，基部圆形，最宽处3-4毫米，为宿萼所斜包，先端有由下基线凸出的小尖；
种子卵形，黑色，长约2毫米。
花期6-7月，果期7-8月。
