糠秕马先蒿的花冠紫红色，管长6毫米，无毛，喉部扩大，脉纹显著扭转，使其冠之上部多少返顾，盔的直立部分约与管等长，端以直角转折而成合有雄蕊的部分，前方再渐狭为喙，喙长约5毫米，端二裂，其裂片自身再作浅二裂，外方一枚小裂卵形，较大很多，较突然地凸出。
糠秕马先蒿的蒴果披针形，长10-15毫米，基部圆形，最宽处3-4毫米，为宿萼所斜包，先端有由下基线凸出的小尖。
糠秕马先蒿的高度范围是6-45厘米。
糠秕马先蒿的花序疏总状，苞片叶状而长于花；萼斜卵状而狭，薄而膜质，长6-7毫米，前方深裂至2/3，密被白色柔毛，外面脉纹显明，齿5枚，长约0.3-1.5毫米，几全缘或有不显之锯齿。