臭黄堇，无毛丛生草本，高30-50厘米，具主根。
茎具棱，枝条花亭状，对叶生，稀腋生。
基生叶多数，高约10厘米；
叶柄约与叶片等长，基部具鞘；
叶片卵圆形，2-3回羽状全裂，一回羽片5-9枚，具短柄，二回羽片约3枚，无柄，通常二回三深裂，有时侧生裂片全缘，末回裂片披针形，约长5毫米，宽1-2毫米。
茎生叶与基生叶同形，但叶柄基部不具鞘。
总状花序顶生和对叶生，长5-10厘米，多花，先密集，后疏离。
苞片卵圆形或披针形，稍长于花梗。
花梗长约3毫米。
花黄色，平展。
萼片卵圆形，长约1.5毫米。
外花瓣渐尖，无鸡冠状突起或极不明显。
上花瓣长约1.5厘米，距约占花瓣全长的1/4，短囊状，下弯。
下花瓣长约1.2厘米，舟状。
内花瓣具半圆形鸡冠状突起，爪丝状，约与瓣片等长。
雄蕊束披针形，上部缢缩成丝状。
柱头横向呈两臂伸出，两端各具2-3乳突。
蒴果线形，长2-3厘米，宽约2毫米，近镰形弯曲，具1列种子。
种子直径约1.5毫米，具杯状的种阜。