金雀花紫堇，直立草本，高15-40（-60）厘米。
须根多数成簇，狭纺锤状圆柱形，长1-3厘米，粗不足1毫米，有时为粗线形，具纤维状细根。
茎1-6，有时粗壮，不分枝，上部具叶，下部裸露，基部变细。
基生叶2-8枚，叶柄长4-12厘米，下部变细，叶片轮廓近圆形或肾形，直径1.5-3厘米，3全裂，全裂片无柄，再次2-3深裂至近基部，小裂片倒卵状长圆形或倒卵形，长0.5-1.7厘米，宽2-8毫米，先端圆，基部楔形，纵脉明显；
茎生叶1-2枚，稀3或更多，生于茎上部，无柄或具极短柄，叶片掌状5-9全裂，裂片线状披针形，长1.5-4.5厘米，宽1.5-8毫米，全缘，先端急尖或钝，背面具白粉，纵脉3条。
总状花序顶生，长3-6 (-10)厘米，有10-20花或更多，排列密集，果期延长，稀疏；
苞片最下部者3-5全裂，其余卵状披针形至狭披针形、全缘；
花梗劲直，比苞片稍长。
萼片鳞片状，极小，撕裂状锐裂，晚落；
花瓣黄色，上花瓣长1.7-2厘米，花瓣片舟状卵形，先端具短尖，边缘开展，背部鸡冠状突起自先端稍后开始，延伸至距中部逐渐消失，距圆筒形，粗壮，与花瓣片近等长，末端圆，向上弯曲，下花瓣长1-1.2厘米，花瓣片近圆形，直径5-7毫米，先端具钝尖头，边缘略呈浅波状，背部无鸡冠状突起，爪楔形，略短于花瓣片，内花瓣提琴形，长0.6-0.8厘米，花瓣片先端圆，有1大的侧生囊，爪楔形，与花瓣片近等长；
雄蕊束长0.6-0.8厘米，花药小，花丝卵状披针形，上部1/3突然变线形，蜜腺体贯穿距的3/5；
子房线形，长约5毫米，具1列胚珠，花柱稍短于子房，先端弯曲，柱头双卵形，具6个乳突。
蒴果线形，长达1.5厘米，成熟时自果梗先端反折，具1列种子。
种子近圆形，直径1-1.5毫米，黑色，光亮，具不明显的条纹；
种阜小。
花果期5-7月。
