小药八旦子，瘦弱多年生草本，高约15-20厘米。
块茎圆球形或长圆形，长8-20毫米，宽8-12毫米。
茎基以上具1-2鳞片，鳞片上部具叶，枝条多发自叶腋，少数发自鳞片腋内。
叶(1-)-2(-3)回三出，具细长的叶柄和小叶柄；
叶柄基部常具叶鞘；
小叶圆形至椭圆形，有时浅裂，下部苍白色，长9-25毫米，宽7-15毫米。
总状花序具3-8花，疏离。
苞片卵圆形或倒卵形，下部的较大，约长6毫米，宽3毫米。
花梗明显长于苞片，下部的长15-25(-40)毫米。
萼片小，早落。
花蓝色或紫蓝色。
上花瓣长约2厘米，瓣片较宽展，顶端微凹；
距圆筒形，弧形上弯，长(1-)1.2-1.4厘米；
蜜腺体约贯穿距长的3/4，顶端钝。
下花瓣长约1厘米，瓣片宽展，微凹，基部具宽大的浅囊。
内花瓣长7-8毫米。
柱头四方形，上端具4乳突，下部具2尾状的乳突。
蒴果卵圆形至椭圆形，长8-15毫米，具4-9种子。
种子光滑，直径约2毫米，具狭长的种阜。
