黑穗薹草,根状茎短。
秆密丛生,高15-65厘米,三棱形,上部稍粗糙,顶端稍向下倾斜,基部叶鞘无叶片,紫红色,稍网状分裂。
叶短于秆,宽3-5毫米,稍粗糙。
苞片最下部的1-2枚叶状,无鞘,上部的刚毛状或鳞片状。
小穗3-5个,接近,顶生小穗雌雄顺序,倒卵形或长圆状倒卵形。
侧生小穗雌性,长圆形,长1-1.5厘米,宽约5-6毫米;
下部2个具长柄,稍下垂。
雌花鳞片卵形至狭卵形,顶端稍急尖至渐尖,褐色,黑褐色至紫褐色,背部中脉色淡。
果囊与鳞片几等长或稍短或稍长,椭圆形或卵形,长3-3.5毫米,淡褐色,顶端深褐色或带紫褐色,无脉,无毛,基部圆形,顶端急缩成圆柱状的短喙,喙口浅2齿裂。
小坚果疏松地包于果囊之下半部,倒卵形,三棱形,长1.5-1.7毫米;
花柱基部不增粗,柱头3个。