准噶尔薹草，根状茎具长而粗的地下匍匐茎。
秆高30-50厘米，三棱形，上部粗糙，基部包以红褐色无叶片的鞘，老叶鞘常细裂成网状。
叶短于秆，宽3-5毫米，平张或稍折合，纵脉间横隔节明显，具叶鞘。
苞片叶状，长于花序，最下面的苞片具很短的鞘，上面的苞片无鞘。
小穗3-4个，上端1-2个为雄小穗，间距短，狭棍棒形，长1.5-2厘米，近于无柄；
其余小穗为雌小穗，间距较长，圆柱形，长2-4厘米，宽5-6毫米，密生多数花，基部较稀疏，具短柄，最下面的一个柄长约1厘米左右。
雌花鳞片卵形，长约3毫米，顶端渐尖，两侧棕色，中间色浅，具3条脉。
果囊斜展，长于鳞片，卵圆形或宽卵圆形，双凸形，长3-4毫米，革质，橙黄色或锈褐色，具光泽，具多条细脉，基部圆形，顶端急缩成较宽而很短的喙，喙口具两短齿。
小坚果椭圆形或卵状椭圆形，三棱形，长约2毫米，基部具短柄，顶端具短尖；
花柱基部弯曲，不增粗，柱头3个。
花果期4-6月。
