钝叶眼子菜，沉水草本，无根茎。
茎椭圆柱形或近圆柱形，径约0.8毫米，具分枝，近基部常匍匐并于节处疏生白色而纤长的须根；
茎节生有一对较大而明显的腺体，节间长3-7厘米。
叶线形，无柄，长3-6厘米，宽约2毫米，先端渐尖或急尖，或具小突尖，全缘；
叶脉3或5条，中脉明显，两侧伴有数条通气组织所形成的细纹，侧脉较细弱，但清晰可见；
托叶淡绿色或近无色，膜质，与叶片离生，长1-1.2厘米，不合生成套管状，仅边缘叠压而抱茎；
休眠芽为侧生短枝状，多叶，不明显特化。
穗状花序顶生或假腋生，通常具花2-3轮；
花序梗自下而上稍膨大，略扁；
花小，被片绿色，雌蕊4枚。
果实斜倒卵形，长约3毫米，果喙近于头状，龙骨脊锐。
花果期6-10月。
2n=26。