皱褶马先蒿，多年生草本，中下高低，高可达20余厘米，干时略变黑色，草质。
根常粗壮，径达6毫米，有分枝，肉质，长达10厘米以上，根颈上有少数宽卵形鳞片，并有翌年鳞片脱落痕迹。
茎单条或2-6条自根颈并发，中间者直立，外方者弯曲上升，黑色，圆筒形而有微稜，有成行之毛，毛疏密多变。
叶基出者长期宿存，有长柄，柄长达30余毫米，基部多少膜质，长过叶片，常多少有白色伸张之毛；
叶片长1-3厘米，羽状深裂或几全裂，裂片6-12对，卵状长圆形，羽状浅裂至半裂，小裂片长不超过0.5毫米，多少卵形，缘有锯齿而常反卷，齿常有白色胼胝，面上中肋下陷，沟中有短细毛，背面几光滑，惟幼时后半部常有疏生长白毛，茎叶仅1-2轮，每轮常4枚，与基出叶相同而较小，柄亦较短，仅长1-1.5厘米。
花序穗状而粗短，长达7厘米，在生于侧茎顶端者常为头状而短，长仅3厘米左右，花盛开时宽达4.5厘米，最下一个花轮有时有相当间距；
苞片下部者叶状而与花等长，上部者柄变宽而为膜质，披针形，端叶片状而3裂，最上者披针形，端仅有锯齿，短于花，疏生白色长毛；
萼长9-13毫米，前方开裂几达一半，主次脉10条明显，齿5枚，有时不分明，大小不等，有锯齿而缘常反卷，前侧方两枚常向裂口延下；
花冠大小相差很多，长16-23毫米，管在近基的1/3处向前上方弓曲而自萼的裂口中斜倾伸出，使花前俯，至上部1/3处又向上方转折而喉部强烈扩大，下唇长7-9毫米，侧裂为直置的肾脏形，前后端均凸出作耳形，中裂向前伸出，有明显之柄，柄长约1.4-2毫米或稍多，片圆形，长3.5-3.8毫米，宽3.2-4.5毫米，盔粗壮，长5.5-9毫米，宽2.5-3.5毫米，作极微的膝盖状镰状弓曲，前缘近基部处向下变宽而连于下唇，上方粗细几一致，稍向内褶，颏部亦有不明显之皱摺1条，端圆钝而略带方形，几无凸尖；
雄蕊药室具刺尖，花丝无毛；
柱头多少伸出。
花期7-8月。
