长舟马先蒿，多年生草本，干时变为黑色，高低多变化，低者仅1.3厘米，高者可达40厘米，仅偶然分枝；
须根成丛，生于根颈之上，后者下连于鞭状根茎，深入地下的粗根茎未见。
茎有沟稜，沟中生有成条的褐色毛，上部较密。
叶卵状长圆形至披针状长圆形，中部者最大，两端者较小，基部者鳞片状，无柄而多少抱茎，缘有浅裂或重齿，裂片或齿圆形，上有细齿，长2.5-6厘米，宽3-20毫米，上面除中肋上密生褐色短毛外几无毛，下面仅中肋上散生疏长毛。
花序从头状仅含3-4花至短总状而含10余花，在果中可长达12厘米；
苞片叶状而短；
萼宽钟形，长约9毫米，5齿，齿均为卵形，有锯齿；
花冠之管伸出于萼约达5毫米，无毛，下唇斜展，基部广楔形，前端3裂，裂片卵形，几相等，短于盔部，盔仅稍向前俯，故指向前上方，含有雄蕊部分很膨大，长达10-12毫米，全面有疏毛，下缘密生长须毛，前端狭缩为短而清晰的小喙；
雄蕊花丝两对均无毛；
花柱在喙端伸出甚长，达8毫米，常向下弯曲。
蒴果包于宿萼内，前端伸出，黑色，扁卵圆形，有小凸尖，长达20毫米，宽9毫米，两室相等；
种子肾脏形（？未熟），有蜂窝状孔纹。
花期8月。
