矮鸢尾，多年生密丛草本，植株基部围有残留折断的老叶叶鞘，黄褐或棕褐色。
根状茎块状，短粗，木质，棕褐色；
须根黄棕色，分枝少。
叶略扭曲，狭条形，长10-20厘米，宽约3毫米，顶端渐尖，无明显的中脉。
花茎短，一般不伸出地面；
苞片2-3枚，草质，绿色，狭披针形，长6-8厘米，宽0.8-1厘米，顶端长渐尖，其中包含1-2朵花；
花蓝色带有黄斑，直径约3厘米；
花梗较短，长约1.5厘米；
花被管细长，长4-5 厘米，外花被裂片狭倒披针形，长约3厘米，宽约5毫米，上部向外反折，爪部狭楔形，呈沟状，内花被裂片狭倒披针形，长约2厘米，宽2-3毫米，直立；
雄蕊长1.5-1.8厘米，花药黄色或黄褐色；
花柱分枝较花被裂片略短而狭，顶端裂片丝状，狭三角形，子房细圆柱形，长约1厘米。
蒴果长圆形，长约2厘米，直径7-8毫米，有6条突起的肋，顶端有短喙。
花期5月，果期6-8月。
