祁连山附地菜，多年生密丛草本。
茎基短缩，向下生多数垂直的长根及纤维状须根。
茎细弱，多条簇生，直立或斜升，高15-20厘米，疏生细伏毛。
基生叶具长柄，柄长2-4厘米，细弱，被稀疏短伏毛，叶片长圆形、椭圆形或近圆形，大小不等，长0.7-4厘米，宽0.7-1.5厘米，先端圆具短尖，基部圆或略呈浅心形稀宽楔形，两面被稀疏的短伏毛；
茎上部叶椭圆形，具短柄。
花序顶生，细弱，中下部具2-3枚叶状苞片，上部无苞片；
花梗细长，丝状，长1-2.5厘米，斜升或近平伸；
花萼裂片卵形，长1.5-2毫米，先端尖；
花冠淡蓝色，直径约3毫米，筒部短粗，长约1毫米，粗约1.5毫米，裂片近圆形，喉部附属物5，较明显，高约0.5毫米。
小坚果斜三棱锥状四面体形，被短柔毛，暗褐色，背面凸，呈三角状卵形，长约1.5毫米，顶端尖，具3个锐棱，腹面的基底面向下方隆起，其余2个侧面平且中央具1纵棱，有向一侧弯曲之短柄。
