短头唇柱苣苔，多年生草本。
根状茎长约2厘米，粗约8毫米。
叶约4，均基生，具短柄或近无柄；
叶片干时革质，两侧不相等，圆卵形或卵形，长1.2-3厘米，宽0.9-1.8厘米，顶端圆形或钝，基部宽楔形，边缘全缘，两面被白色短伏毛，侧脉每侧3-4条，上面不明显；
叶柄扁，长1-5毫米，宽2.5-4毫米。
花序有1-2花；
花序梗渐升，长9-11.5厘米，被紫色开展短柔毛；
苞片对生，披针形，长约5毫米，宽1.6毫米，顶端钝。
花萼5裂达基部，裂片披针状狭线形，长6.5-7毫米，宽1-1.2(-1.5）毫米，顶端微钝，外面被紫色短柔毛，内面无毛。
花冠长约3.4厘米，外面疏被短柔毛，内面在上唇密被短柔毛；
筒细漏斗状，长约2.2厘米，口部直径约0.8厘米，上唇长约6毫米，2浅裂，下唇长12毫米，3浅裂，裂片宽卵形。
雄蕊的花丝与退化雄蕊着生于距花冠基部11毫米处，长约8毫米，下部宽1.1毫米，上部宽0.3毫米，在中部之下强烈膝状弯曲，上部疏被短腺毛，花药长3毫米，背面被柔毛；
退化雄蕊2，狭线形，长4.5毫米，疏被短柔毛，顶端稍变粗。
花盘环状，高约1毫米。
雌蕊子房线形，密被短柔毛，柱头小，圆卵形，长约0.8毫米，不分裂。
花期4-5月。