南芥属，一年生、二年生或多年生草本，很少呈半灌木状。
茎直立或匍匐，有单毛、2-3叉毛、星状毛或分枝毛。
基生叶簇生，有或无叶柄；
叶多为长椭圆形，全缘、有齿牙或疏齿；
茎生叶有短柄或无柄，基部楔形，有时呈钝形或箭形的叶耳抱茎、半抱茎或不抱茎。
总状花序顶生或腋生；
萼片直立，卵形至长椭圆形，内轮基部呈囊状，边缘白色膜质、背面有毛或无毛；
花瓣白色、很少紫色、蓝紫色或淡红色，倒卵形至楔形，顶端钝，有时略凹入，基部呈爪状；
雄蕊6，花药顶端常反曲；
子房具多数胚珠 (20-60)，柱头头状或2浅裂。
长角果线形，顶端钝或渐尖，直立或下垂，果瓣扁平，开裂，具中脉或无。
种子每室1-2行，边缘有翅或无翅，有时表面具小颗粒状突起；
子叶缘倚胚根。
