香堇菜，多年生草本，无地上茎，具匍匐枝，高3-15厘米。
根状茎较粗，垂直或斜生，淡褐色，密生结节，向下生多数细根，横向发出细长的匍匐枝，其节处生根、发叶而成新植株。
叶基生；
叶片圆形或肾形至宽卵状心形，开花期叶片较小，长与宽均为1.5-2.5厘米，花后叶片渐增大，长宽可达4.5厘米，先端圆或稍尖，基部深心形，边缘具圆钝齿，两面被稀疏短柔毛或近无毛。
花较大，深紫色，有香味；
花梗细长，被细柔毛或近无毛，中部或中部以上有2枚线形小苞片；
萼片长圆形或长圆状卵形，先端钝圆，基部的附属物长0.2-0.3厘米，末端圆钝或具浅齿；
花瓣边缘波状，上方花瓣倒卵形，侧方花瓣里面近基部有短须毛，下方花瓣宽倒卵形，连距长1.5-2厘米；
距长2-4毫米，直或微弯曲；
下方2枚雄蕊之距较粗，长约4毫米；
子房被细柔毛，花柱基部细而直，向上增粗而稍扁，顶部弯曲成钩状短喙，喙长度与花柱直径近相等，喙端具较细的柱头孔。
蒴果球形，密被短柔毛。
