灰岩黄芩的雄蕊有4个，二强；花丝扁平，下部被小纤毛。
灰岩黄芩的花序顶生，长4.5-8厘米，总状花序，花对生，花梗长约3毫米，与序轴密被平展具节疏柔毛。
灰岩黄芩的原变种分布于云南西北部，生于海拔3100-3400米的石灰岩上高山栎丛及落叶松林中。
6月