云南鹿藿，草质或有时近木质藤本，全株密被灰色柔毛或绒毛。
茎稍粗壮，长约50厘米，具明显细纵棱，被微黑褐色小腺点。
叶具羽状3小叶；
托叶披针形，长4-8厘米，常宿存；
叶柄长2.5-6厘米；
小叶纸质，顶生小叶肾形或扁圆形，长2-3.7厘米，宽2.5-5.3厘米；
先端圆形或近截平，常具小凸尖，基部微心形或近截平，边缘微波状，干时略背卷，两面密被灰色柔毛及细微的黑褐色或松脂色的小腺点；
基出脉3，侧脉每边2-4条；
小脉网状，下面较上面明显；
小叶柄长1-3毫米，被毛；
小托叶缺，侧生小叶与顶生小叶相仿，但稍小，略偏斜。
总状花序腋生，稀为单朵或总状花序分枝呈复总状，长2-5厘米；
总花梗长1-3.5厘米，各部密被毛；
苞片披针形，长4-7毫米，宿存；
花黄色，长1.4-2厘米；
花梗长2-8毫米；
花萼5裂，裂片披针形，较萼管长，下面一裂片最长；
旗瓣近圆形或倒卵状圆形，长1-1.5厘米，基部具瓣柄及2耳，无毛，翼瓣椭圆形至倒卵状椭圆形，长7-13毫米，具瓣柄和一侧具耳，龙骨瓣较阔，半倒卵形，具瓣柄，无耳，长7-14毫米；
雄蕊二体；
子房密被丝质毛，无柄，胚珠1-2颗，花柱线状，下部被丝质毛。
荚果倒卵状椭圆形至椭圆形，长约2-2.5厘米，最宽处长7-8毫米，带红褐色，微被短柔毛，先端具喙；
种子肾形或近圆形，长4-5毫米，宽5-6毫米，黑褐色。
