不等裂马先蒿，一年生草本，低矮，高仅3.5-4.5厘米，铺散地面，干时不变黑色。
主根垂直向下，长达3.5厘米，径约2毫米，略略肉质化，下部发出须状支根，根颈生有膜质鳞片2-3对，宽三角形。
茎很短，不计花仅高2厘米，纤细，稍木质化，多分枝，枝对生，与茎均有毛线两条，不连花序仅有节1-2枚。
叶基生者早败，茎生者稀疏而对生，每枝上多仅1对，具长柄，柄长4-9毫米，扁平，基部多少膨大，具狭翅，有疏长毛或几无毛；
叶片厚纸质，卵形至长圆状卵形，基部心脏形，长2-6毫米，宽1.5-4毫米，侧脉不著，上面密被细而短的腺毛，背面疏生白色肤屑状物，羽状深裂，裂片3-4对。
宽卵形，有缺刻状大齿及反卷的小齿。
花每枝端有1-2对，花梗长达6毫米，纤细，有疏毛；
萼膜质，粗管状，长约8毫米，前方不裂，主脉细而不很显著，为疏网脉所串连，疏被白色多细胞长毛，以主脉上尤密；
萼齿5枚，后方1枚较小，基部宽三角形而低，再上即为大针形而全缘，其余4枚下半膜质有网脉，上半绿色叶状，后侧方两枚最大，下部宽达1.5毫米，上半掌状3-4 裂，前侧方两枚较小一半，缘有反卷的大圆齿而不裂；
花冠长约24毫米，黄色，管伸直，长约9-10毫米，喉部被短毛，盔长约14毫米，中上部作镰形弓曲，舍有雄蕊的部分稍扩大，端尖削，前缘无凹缺，约在距离3毫米处有短齿1对，长不及0.5毫米；
下唇短于盔，具长1.5毫米的宽柄，无缘毛，略有啮痕状细齿，裂片多少圆形，中裂比侧裂大一倍，有明显之柄，长1.5毫米，其片长4.5-5毫米，大部向前凸出，侧裂亦有短柄；
雄蕊着生于管的基部稍上处，花丝仅着生处有短毛；
子房狭卵圆形，长约3毫米，一侧生有代表花盘的长1毫米的附属物，基部竟而环抱子房，上部圆锥形，下部1/3与子房贴着，柱头约伸出于盔外1.5-2毫米。
