江南马先蒿，多年生草本；
根成丛而生，其中有少数肉质膨大作纺锤形，径达4毫米，或全部细弱，长短相去很多。
茎极少单一，多从基部发出3-5条，中空，基部常多少倾卧，下部为圆筒形，而上部略有稜角。
弯曲上升，常多分枝，高达16-35厘米，干时略变黑色，密被锈褐色污毛，老时多少木质化，有时下部横行土中而节节生有细而须状的根。
叶相当茂密，互生，柄纤细，被短柔毛，长约5毫米，在基部叶中者较长，达15毫米；
叶片纸质，长圆状披针形至线状长圆形，长约15毫米，宽5毫米，然在基部的叶中长可达34毫米，宽达8毫米，两面均被短毛，羽状全裂，裂片每边约6-8个，在基部之叶中多达12枚，长圆形至卵形，缘有具白色胼胝之齿而常反卷。
花生于茎枝叶腋中，有时在近中部以下即开始，成为长达20厘米的长总状花序，上端开花而下部已结果，下部之花多疏距；
花梗纤细，长3-5毫米，密被短毛；
萼长达8毫米，多少圆筒形，中间略膨大，前方深裂至一半或大半，齿5枚，或有时退化为3枚，长达1.5毫米，基部细而全缘，端圆形膨大，有反卷之齿，有毛，齿常有胼胝；
花冠浅紫红色，长约18-23毫米，管长9-13毫米，伸直或稍稍在中部向前弓曲，略向右扭转，上部渐渐扩大，盔直立部分长约5毫米，中部向前上方弓曲成为短粗的含有雄蕊的部分，前端狭缩为指向前下方的短喙，喙长约1.5毫米，端2浅裂，下唇与盔等长或稍长，下部以锐角开展，前半部3裂，裂片向前下方张开，近于相等，无缘毛，侧裂较大，斜椭圆形，端圆形，中裂圆形，几不伸出，两侧迭置于侧裂之下；
雄蕊着生花管基部，两对均密被长柔毛；
花柱略伸出。
蒴果斜披针状卵形，从宿萼裂口斜伸而出，长达16毫米，宽达4.5毫米，两室很不等，多少向腹线弓曲，顶有小凸尖；
种子卵形而尖，形如桃，有整齐的纵条纹，褐色，长1毫米左右。
花期5-9月；
果期8-11月。
