全裂马先蒿，多年生草本，干时变为黑色，高约20-35厘米，被短毛或无毛；
根圆锥形，垂直向下，长约5-6厘米，老时肉质增粗，直径可达5-7毫米，无侧根，根颈稍有须根，其端生有少数卵形膜质鳞片。
茎常自基部发出多条，多4-10数，有时亦有单条而在基部分枝者，上部有时也有分枝，茎枝侧出者常弯曲上升，中央者直立，都多少纤细，但老时较坚挺，中空，基部不木质化，稍具稜角，被短毛，有不清楚的毛线。
叶互生，基出者早落，其膜质叶柄常宿存，柄长约3-3.5厘米，扁平，纤细，沿中肋有狭翅，基部及边沿被长纤毛，茎生叶之柄较短，长约1.5-2厘米；
叶片卵状长圆形，膜质，长约3-3.5厘米，宽约1.2 1.6厘米，两面无毛，下面有清晰的碎冰纹网脉，网眼中的叶面凸起，边缘羽状全裂，裂片每边6-9枚，疏距，卵形至线状披针形，宽约1-2毫米，基部下延沿中肋成狭翅，边缘羽状浅裂或有缺刻状重锯齿，齿端有胼胝质小刺尖。
总状花序顶生，伸长，长可达枝的1/2，花疏稀；
苞片叶状，有柄；
花具长梗，长可达2.5厘米，纤细，开花时向上伸直，花后伸长而作种种弯曲，密被短毛；
萼为不整齐的卵圆形，长约4-6毫米，膜质，被短毛或近于无毛，前方开裂至管的中部，裂口多少向前膨撇，主脉3条稍凸出，明显，侧脉多条不整齐，近管部顶端有疏稀网纹，萼齿3枚，长约与萼管相等或稍短，草质，绿色而较厚，不等，后方的一枚较小，线形或大针形，端急尖，全缘，或上部有一对锯齿，侧齿宽大，在基部上作掌状3深裂，裂片上有1-2对疏齿，基部狭成短柄；
花冠黄色，长约10-12毫米，花管伸直，比萼稍长，外微被短毛，盔质立部分短，顶端前缘无耳状凸起，以直角转折成为稍稍膨大的舍雄蕊部分，并向右扭折，因此使盔顶向下，舍有雄蕊部分的前端逐渐变狭，为长约6毫米的缘，端微缺，近端处宽约0.3毫米，亦反指向上并作半环状卷曲，自盔额向前至近缘端处有很狭的鸡冠状凸起一条；
下唇宽大，基部心脏形，3裂，有缘毛，中裂较小，约凸出一半，前方圆形，基部狭缩成明显的柄，侧裂甚大，斜椭圆形；
雄蕊着生于花管的近基处，2对花丝全被长柔毛；
子房卵圆形，柱头稍伸出盔外。
蒴果斜圆卵形，长约4一5毫米，端有短凸尖。
花期6-8月；
果期8月。