二歧马先蒿，多年生草本，干后不变为黑色，植株高可达30厘米以上。
根非肉质。
茎被毛，不分枝或具有对生的枝条。
叶对生，连柄长达7厘米，羽状全裂，裂片线形，深裂几达中肋，边缘具有微微突起的胼胝，植株上方之叶其柄渐变阔。
花序穗状，长短疏密变化甚大，短者仅长5厘米，长者可达12厘米，花的数目自2-3对乃至18对；
苞片卵形，先端羽状全裂，或尾状渐尖而具锯齿，边缘常具纤毛及胼胝；
萼膨大，长卵形，膜质，长13毫米，外面具有稜角，稜上被毛，脉纹显明，齿三角形，后方一枚甚小；
花冠粉红色，伸出萼上，长约2厘米，脉不扭转，下唇儿不开展，3裂，中裂较小，边缘均无波状齿；
盔在前缘具有一对小齿的直立部分之上、以略超过直角的角度向前下方突然转折为含有雄蕊的部分，再前即渐细为伸直之喙；
雄蕊花丝上部均有毛；
柱头稍稍自喙尖伸出。
蒴果卵圆形，棕褐色，被包于膨大的宿萼中，先端有喙状凸尖；
种子近于圆形，长3毫米，宽2-3毫米，有稠密的蜂窝状孔纹。
花期7-9月。
