短唇马先蒿，一年生草本，高25-45厘米，干时不变黑色，近基处老时稍稍木质化，主要为草质。
根垂直向下，圆筒形，不变粗，根颈丛生须状侧根。
茎单条，或自基部成束发出，多至4-5条，直立或在多条的情况下外方者弯曲上升，简单或在下部第一节上分枝，枝对生，主茎下部圆形，中空，被有疏毛，上部有浅纵沟，沟中有成行之白毛。
叶下部者对生，柄细长，达2.5-3厘米，上部之叶4 枚轮生，具短柄或几无柄，叶片长卵形至椭圆状长圆形，长1.5-3厘米，宽1.4-2厘米，羽状深裂，裂片4-8对，长者达7毫米，卵状长圆形，基部扩大而与邻接之裂片相连，缘有不规则锐锯齿。
花序穗状，长者达8厘米，下部的花轮远距，在花序短缩时则多少头状；
苞片叶状，下方者长于花而上方者相等或较短；
萼钟形，管长7-8毫米，脉纹5主5次明显，上被白色长柔毛，前方不开裂，齿5枚，后方1枚较短，三角形，膜质而全缘，其余4枚长2-4毫米，质较厚而为草质绿色，基部以上长而全缘如柄，端卵形膨大，常为不规则3裂或有重锐齿；
花冠浅排色，长1.5-2厘米，花管长6-8毫米，在中部以上而约在萼喉的水平上向前弓曲，端稍扩大，盔长9-12毫米，显比管部为长，基部指向前上方，全长多少镰形弓曲，额圆形，先端略略凸出作截形的小喙状，无齿，下唇亦显短于盔，近于卵形，长6-8毫米，宽6-9毫米，有细缘毛，中裂较小，椭圆状卵形，向前伸出一半，后方侧面与侧裂相迭，并有细褶襞两条通向花喉；
雄蕊着生于管的中部以下，两对花丝均无毛；
花柱不伸出。
花期7月。
