荆芥的花序为聚伞状，下部的腋生，上部的组成连续或间断的、较疏松或极密集的顶生分枝圆锥花序，聚伞花序呈二歧状分枝。
荆芥的茎坚强，基部木质化，多分枝，高40-150厘米，基部近四棱形，上部钝四棱形，具浅槽，被白色短柔毛。
花冠白色，下唇有紫点，外被白色柔毛，内面在喉部被短柔毛，长约7.5毫米。
f. citriodora Dum具有浓郁的柠檬香气，常作芳香油及蜜源植物栽培。