花叶海棠的冬芽小，卵形，先端钝，密被绒毛，暗紫色，有数枚外露鳞片。
花叶海棠的花期是5月，果期是9月。
花叶海棠的果实近球形，直径6-8毫米。
花叶海棠的变种与原变种的主要区别在于果实的形状，变种的果实长圆椭圆形或长圆卵形，而原变种的果实近球形。