黑腺珍珠菜，多年生草本，全体无毛。
茎直立，高40-80厘米，四棱形，棱边有狭翅和黑色腺点，上部分枝。
基生叶匙形，早凋，茎叶对生，无柄，叶片披针形或线状披针形，极少长圆状披针形，长4-13厘米，宽1-3厘米，先端稍锐尖或钝，基部钝或耳状半抱茎，两面密生黑色粒状腺点。
总状花序生于茎端和枝端；
苞片叶状，长于或近等长于花梗；
花梗长3-5毫米；
花萼4-5毫米，分裂近达基部，裂片线状披针形，背面有黑色腺条和腺点；
花冠白色，长约7毫米，基部合生部分长约2.5毫米，裂片卵状长圆形；
雄蕊与花冠近等长，花丝贴生至花冠的中部，分离部分长约3毫米；
花药腺形，长约1.5毫米，药隔顶端具胼低状尖头；
花粉粒具3孔沟，长球形 [(27.5-31) × (18-22.5)微米］，表面近于平滑；
子房无毛，花柱长约6毫米，柱头膨大。
蒴果球形，直径约3毫米。
花期5-7月；
果期8-10月。
