高原百脉根，多年生草本，高不到20厘米，全株被伸展白色长柔毛。
具主根。
茎丛生，直立或上升，四棱形，中空。
羽状复叶小叶5枚，顶端3枚斜倒卵形，长6毫米，宽4-5毫米，先端钝圆，基部楔形，下端2枚斜心形，两侧明显不等大一侧呈耳状，两面被长柔毛，上面多皱，叶脉不明显；
小叶柄短，几无毛。
伞形花序；
总花梗长约为小叶长的2倍，长1-2厘米；
花2-4朵，长8-11毫米；
花梗甚短；
花梗基部有3枚叶状苞片，长为萼的四分之一至三分之一；
萼钟形，长约6毫米，宽4毫米，被长柔毛，萼齿三角形，略尖，略长于萼筒；
花冠黄色，旗瓣圆形，长于翼瓣和龙骨瓣，瓣片渐狭成瓣柄，翼瓣阔长圆形，龙骨瓣稍长于翼瓣，喙狭尖；
雄蕊两体，花丝分离部约占三分之一；
花柱直，上指子房线形，无毛，胚珠约35粒。
花期6-8月。
