凤庆长蒴苣苔，多年生草本。
茎高8-18厘米，粗1.5-3.5毫米，密被贴伏褐黄色柔毛，不分枝，顶部有2-3个密集的节。
叶对生，具柄或近无柄，密集，同一对叶不等大；
叶片草质，两侧不相等，斜椭圆形或菱状椭圆形，长3.5-16厘米，宽2-9厘米，顶端急尖或钝，基部斜楔形，或一侧楔形，另一侧圆形，边缘有重牙齿，两面多少密被短柔毛，侧脉每侧5-8条；
叶柄长达2.8厘米。
聚伞花序腋生，长8-18厘米，2-4回分枝，有少或多数花；
花序梗长4-8厘米，与花梗有稀疏短腺毛；
苞片对生，紫色，圆卵形，长约3毫米；
花梗长3-10毫米。
花萼钟状，长约4.5毫米，无毛，3裂达基部，前2裂片长圆形，宽约1.5毫米，顶端钝，后裂片较大，楔形，宽3毫米，3浅裂，小裂片近正三角形，长0.5-1毫米。
花冠紫色，长约2.5厘米，无毛；
筒长约1.8厘米，口部直径3毫米；
上唇长3毫米，2深裂，下唇长约7毫米，3浅裂，裂片近圆形。
雄蕊花丝着生于距花冠基部13毫米处，长约3.5毫米，无毛，花药长1.5毫米，被短柔毛；
退化雄蕊2，狭线形，长0.8-1毫米，无毛，顶端头状。
花盘杯状，高约1.5毫米。
雌蕊长约1.6厘米，无毛，子房线形，长11毫米，宽1毫米，柱头盘状，直径1毫米。
蒴果长1.8-2.8厘米，宽1.6毫米，无毛。
种子纺锤形，长约0.3毫米。
花期7月。