石生黄堇，淡绿色易萎软草本，高30-40厘米，具粗大主根和单头至多头的根茎。
茎分枝或不分枝；
枝条与叶对生，花葶状。
基生叶长约10-15厘米，具长柄，叶片约与叶柄等长，二回至一回羽状全裂，末回羽片楔形至倒卵形，约长2-4厘米，宽2-3厘米，不等大2-3裂或边缘具粗圆齿。
总状花序长约7-15厘米，多花，先密集，后疏离。
苞片椭圆形至披针形，全缘，下部的约长1.5厘米，宽1厘米，上部的渐狭小，全部长于花梗。
花梗长约5毫米。
花金黄色，平展。
萼片近三角形，全缘，长约2毫米。
外花瓣较宽展，渐尖，鸡冠状突起仅限于龙骨状突起之上，不伸达顶端。
上花瓣长约2.5厘米；
距约占花瓣全长的1/4，稍下弯，末端囊状；
蜜腺体短，约贯穿距长的1/2。
下花瓣长约1.8厘米，基部近具小瘤状突起。
内花瓣长约 1.5厘米，具厚而伸出顶端的鸡冠状突起。
雄蕊束披针形，中部以上渐缢缩。
柱头2叉状分裂，各枝顶端具2裂的乳突。
蒴果线形，下弯，长约2.5厘米，具1列种子。
