少子黄堇，多年生丛生草本，高10-20厘米。
主根长约5-10厘米，顶端被多数草黄色叶柄残基。
茎多数，发自基生叶腋，具1-2叶，不分枝或少分枝。
基生叶多数，长10-15厘米；
叶柄约与叶片等长或较长，下部呈草黄色鞘状宽展，中部以上渐变狭；
叶片长圆形，约长4厘米，宽2-2.2厘米，羽状全裂；
羽片约7枚，互生或近对生，约长1厘米，宽1厘米，近无柄，通常二回三深裂，有时顶生一回裂片不分裂，末回裂片倒卵状披针形或披针形，长4-7毫米，宽2-4毫米，近具短尖。
茎生叶与基生叶同形，但叶柄较短，常宽展至叶片。
总状花序长约5厘米，多花、疏离，果期伸长达9厘米。
下部苞片长2-2.5厘米，叶状或羽状分裂，上部的长1-1.5厘米。
花梗长约1.2厘米，果期长2.5-3厘米，下弯。
萼片小，半圆形，具流苏状缺刻。
花黄色，近平展，外花瓣背部带紫褐色。
上花瓣长约2厘米，渐尖，两侧具1条延伸至距的纵脉，具浅鸡冠状突起；
距圆筒形，约占花瓣全长的3/5；
蜜腺体约贯穿距长的1/2。
下花瓣长约1厘米，具浅鸡冠状突起。
内花瓣长约8毫米，顶端带紫褐色；
爪明显短于瓣片。
雄蕊束披针形。
子房长圆形，约与花柱等长；
柱头扁四方形，顶端具4乳突，基部稍下延，侧面具一对不显的乳突。
蒴果俯垂，倒卵形，长8-12毫米，宽3-4毫米，具1-2粒种子。
种子近圆形，直径约2-2.5毫米，黑亮，平滑，多少具喙；
种阜带状，质厚，长约1.5毫米，不贴生，下半部黑色，上半部黄棕色。