会泽紫堇，直立草本。
根未见。
茎劲直，多分枝，分枝和茎具数条纵棱，被淡色微柔毛。
基生叶未见；
茎生叶数枚，疏离互生，下部叶具较长的柄，上部叶具短柄，叶片轮廓卵形，三回羽状细裂，第一回裂片3-4对，具柄，第二回裂片约3对，近无柄，末回裂片条形或狭披针形，先端急尖，表面干时呈褐色，背面灰绿色。
总状花序顶生，长4-7厘米，果时延长至15厘米，具多数花；
苞片最下部者同上部茎生叶，向上裂片渐减，至最上部者为狭披针形或条形、全缘；
花梗纤细，长于苞片。
萼片鳞片状，近圆形，膜质，边缘撕裂状；
花瓣蓝紫色，纤细，略呈“V”字形，上花瓣长1.5-1.7厘米，花瓣片舟状卵形，先端锐尖，边缘微波状，背部无鸡冠状突起，距纤细，圆筒形，与花瓣片近等长，向上弯曲，下花瓣稍长于上花瓣片，其它与其相同，内花瓣提琴形，长0.8-0.9厘米，花瓣片倒卵形，具1侧生囊，爪楔状条形，比花瓣片长；
雄蕊束长6-7毫米，花药极小，花丝条形，蜜腺体贯穿距的2/3；
子房线形，长约0.4厘米，胚珠多数，排成1列，花柱短于子房，柱头近圆形，具6个乳突。
蒴果线形，长约1.5厘米，粗约1.5毫米，成熟时在果梗先端反折，有多数种子，排成1列。
种子近圆形，黑色，具光泽，表面具不明显的细条纹。
花果期6月前后。