薯根延胡索，多年生草本，高10-25厘米，上升或近直立。
块茎扁圆球形，马铃薯状，直径4-6厘米。
茎不分枝，具2枚对生叶，叶无柄，2-3回三出，末回小叶宽卵形至椭圆 形，顶生的约长2.5厘米，宽2厘米，侧生的较小，具明显的纵脉。
总状花序明显高出叶，具4-10（-14）花。
苞片椭圆形至倒卵形，全缘，多少具短尖。
花梗长约2-9(-12)毫米，明显短于苞片，果期多少直立。
花具淡紫色顶端和粉红色或近白色的距，稀为红紫色或近白色。
萼片小，直径不足1毫米。
外花瓣较狭，急尖至渐尖。
上花瓣长1.6-2.7厘米；
距长9-15(-18)毫米，常上弯，近末端常多少膨大，但有时亦有较细瘦和近直的；
蜜腺体明显短于距，约占距长的1/2至2/3，末端上弯。
下花瓣瓣片明显反折。
内花瓣长9-15毫米。
蒴果椭圆形，直立或斜伸，约长10毫米，宽5毫米，具2列种子。
种子直径约2-2.5毫米；
种阜厚而圆，帽状。
