高冠黄堇，多年生草本，高55-75厘米。
须根多数，粗线形，长达9厘米，粗2-3毫米。
茎直立，具棱，有分枝。
基生叶多数，开花期枯萎，留下残枯的叶基，叶柄宽和长，均具宽鞘，叶片未见；
茎生叶数枚，下部叶柄长达12厘米，粗壮，上部叶柄较短，叶片轮廓宽卵形，四回分裂，第一回三出全裂，具长柄，第二回三出全裂，具短柄，第三回不规则的羽状全裂或深裂，小裂片披针形至线形，2-3浅裂或全缘。
总状花序顶生和侧生，长5-9厘米，有多数花，组成宽大的圆锥花序；
苞片最下部者具缺刻，其余线形；
花梗纤细，短于苞片。
花瓣黄色，上花瓣长2-2.5厘米，先端钝，背部鸡冠状突起高达3毫米，超出花瓣片先端，延伸至其末端，距圆筒形，与花瓣片近等长，下花瓣舟状，长1-1.2厘米，先端钝，中部稍缢缩，基部具1短爪，鸡冠状突起较上花瓣的矮，内花瓣长0.7-0.9厘米，先端色较深；
子房线形，与花柱近等长。
蒴果卵形，具2列种子。
花果期7-9月。