凯里紫堇，多年生草本，灰绿色，高约30厘米。
根茎粗短，具多数纤维状须根，顶端发出多头。
茎多数，具叶，分枝。
基生叶少数而较小，长约3-5厘米，常早凋萎。
茎生叶互生，下部的长约15厘米，具长柄；
叶柄基部多少鞘状宽展，叶片绿色，背面灰绿色，二回羽状全裂或二回三出，一回羽片具短柄，二回羽片近无柄，楔形或倒卵形，约长1.5-2厘米，宽1-1.5厘米，具圆齿。
花序伞房状或近伞形，具2-4花。
苞片叶状，三深裂至三浅裂，约长10毫米，宽8毫米，具缺刻状圆齿。
花梗长约1厘米，果期长达1.5-2厘米。
萼片小，半圆形，具齿。
花紫色、淡紫色或白色，平展。
上花瓣长约2.5厘米，无鸡冠突起，宽展，顶端微凹，具短尖；
距漏斗状，较纤细，约占花瓣全长的2/3；
蜜腺体约占距长的1/2。
下花瓣长约1厘米，顶端微凹，具短尖，基部近具小瘤状突起。
内花瓣长约1厘米，具鸡冠状突起，爪楔形，约与瓣片等长。
雄蕊束披针形，上部渐变狭。
子房长圆形；
花柱长约3毫米；
柱头长圆状三角形，边缘具10乳突。
蒴果长圆形，长约1.4厘米，宽约4毫米，具2列种子。
种子近圆形，直径约1毫米；
种阜小，线形。